Als anspruchsvollster Getreideart, die dies auch mit entsprechenden Erträgen, Qualitäten und somit Erlösen danken kann, steht dem Weizen die beste Fruchtfolgestellung nach Leguminosen zu. Leguminosen werden meist als Futterpflanzen (oder als Stilllegung) in Form eines ein- oder mehrjährigen Kleegrases bzw. einer Klee- oder Luzernereinsaat angebaut. Mit Reinsaaten ist eine höhere Stickstofffixierung zu erzielen.

Nach höheren Leguminosenanteilen kann die Stickstoffversorgung, insbesondere zur Erzeugung der vom Markt geforderten Qualitäten, schon knapp sein. Insbesondere Erbsen zeigen bezüglich der Stickstoffverfügbarkeit zwar eine relativ schnelle Umsetzung, aber wenig Nachhaltevermögen. Ackerbohnen sind hier etwas besser einzustufen, ohne in dieser Hinsicht wirklich gut zu sein.

Weizen kann auch erfolgreich nach Kartoffeln angebaut werden, wenn diese direkt nach Futterbau oder Stilllegung gesetzt wurden. Hier nutzt der Weizen insbesondere die von der Kartoffel hinterlassene gute Bodenstruktur sowie die Nachwirkungen der Kartoffel-Vorfrucht beziehungsweise den organischen Dünger aus Pflanzenrückständen. Sowohl beim Ertrag als auch bei der Qualität kann diese Stellung hinsichtlich des Weizens durchaus konkurrieren mit der umgekehrten Variante (also Kartoffel nach Weizen).

Die im konventionellen Anbau klassischen Weizenvorfrüchte Raps, Zuckerrüben und  Mais spielen vom Anbauumfang her eine untergeordnete Rolle und lassen einen Qualitätsweizenanbau unter den meisten Standortvoraussetzungen nicht zu. Diese Fruchtfolgestellung hat meist nur in der Umstellung oder zur Futtererzeugung eine Bedeutung. Weizen sollte unter ökologischen Bedingungen nie nacheinander oder nach eine andere Getreideart gestellt werden.

Alle anderen Getreidearten sind im Vergleich zu Weizen weniger anspruchsvoll. Sie können jeweils direkt nach Weizen folgen. Hinsichtlich ihrer Ansprüche können sie in einer Rangfolge wie folgt eingegliedert werden: Gerste > Triticale > Hafer > Roggen.

Dinkel

Dinkel nimmt eine gewisse Sonderstellung ein, weil seine Verwandtschaft zum Weizen auch ein zusätzliches Pilzproblem mitbringt, so dass ein Anbau nach Weizen möglichst zu vermeiden ist. Er wird meist anstelle von Weizen auf den etwas schwächeren Standorten oder nach Körnerleguminosen angebaut.

Sommergerste und Hafer

Sommergerste und Hafer sind als Sommerungen auch zum Wechsel in der Fruchtfolge interessant. Hafer stellt keine großen Fruchtfolgeansprüche. Er weist von allen Getreidearten den deutlich geringsten Ertragsrückgang nach einer Umstellung auf ökologischen Landbau auf, sofern die Wasserversorgung gesichert ist.

Roggen

Roggen hat von allen Getreidearten die insgesamt geringsten Ansprüche. Er verträgt darüber hinaus auch ohne Schwierigkeiten einen Nachbau. Der zweite Roggen kann möglicherweise sogar besser im Ertrag sein, wenn es ein insgesamt besseres Roggenjahr ist.

Winterformen

Die Winterformen von Gerste, Roggen und Triticale haben wegen ihres relativ frühen Startes einen entsprechend frühen Nährstoffbedarf. Dieser kann in der Regel nicht aus Bodenvorräten gedeckt werden, weil zu diesem Zeitpunkt bei kaltem Boden noch eine ausreichende Mineralisierung gegeben ist. Hier ist gegebenenfalls eine Güllegabe insbesondere in kalten, nassen Frühjahren hilfreich.

Bestellung, Pflege, Ernte

Hinsichtlich der Bestellung und insbesondere der Ernte zeigen sich bei den Getreidearten keine grundsätzlichen Unterschiede, die auf die ökologische Bewirtschaftung zurückzuführen sind. Die bekannten Eigenheiten der Früchte zeigen sich bei grober Betrachtung unabhängig von den Bewirtschaftungssystemen. Während Weizen etwa hohe Ansprüche an den Boden, aber geringe an die Saat stellt, ist Roggen wenig bedürftig gegenüber dem Boden, aber sehr anspruchsvoll bezüglich der Saatbedingungen. Bei genauerer Betrachtung gibt es jedoch durchaus Unterschiede.

Da das Wachstum unter ökologischen Bedingungen stärker von einer intakten Bodenstruktur und einem aktiven Bodenleben abhängig ist, sind die Ansprüche an möglichst optimale Bedingungen zur Bodenbearbeitung und Saat generell höher. Das zur Verfügung stehende Zeitfenster für die Bestellung im Mittel der Jahre ist tendenziell enger und in der Betriebsorganisation unbedingt zu beachten. Darüber hinaus ist normalerweise mit geringeren Bestockungsfaktoren zu rechnen. Dies sollte generell über eine in der Regel etwas höhere Aussaatstärke (circa 10 Prozent) und eine tendenziell etwas frühere Aussaat bei Winterungen kompensiert werden. So kann eine auch für die Unkrautunterdrückung notwendige ausreichende Bestandesdichte gewährleistet werden.

Der bekannte Antagonismus "Quantität - Qualität" zeigt sich insbesondere bei der sicheren Erzeugung von Qualitätsweizen. Frühe Aussaaten bringen zwar tendenziell höhere Erträge, aber erhöhen auch die Wahrscheinlichkeit, die geforderten Kleberwerte nicht zu erreichen. Spätsaaten stellen quasi eine künstliche Ertragsbegrenzung mit dem Ziel der Qualitätsabsicherung dar, bringen aber das Witterungsrisiko mit. Hier ist ein gutes Einschätzen der Standorteigenschaften, aber auch des eigenen Risikopotenzials besonders wichtig.

Spätsaaten bei Roggen sind fast immer problematisch. Was er vor Winter nicht angelegt hat, kann er im Frühjahr - im Gegensatz zum Weizen - nicht mehr ausgleichen. Die gegenteilige Entwicklung, also ausgesprochene Frühsaaten, ist aber auch - zumindest langfristig betrachtet - nicht frei von Risiken. Während diese beim Roggen auf Grund seiner geringen Pilz- und Unkrautgefährdung keine nennenswerte Bedeutung haben (und der Roggen ohnehin kaum durch eine überfrühe Saatzeit profitieren kann), ist das Gefährdungspotenzial beim Weizen deutlich höher. Ein warmer Herbst und ein milder, niederschlagsreicher Winter können hier für erhebliche Probleme sorgen.

Die Unkrautregulierung erfolgt zumeist über den Hackstriegel. In der Regel werden zwei Arbeitsgänge, bei Roggen eher weniger (teilweise überhaupt nicht), bei Weizen auch mal drei (zum Beispiel Kämmen von Klettenlabkraut) ausgeführt. Generell ist von zu häufigem Striegeln abzuraten, weil es zum einen für die Kulturpflanze ein gewisser Stress ist und zum andern auch kaum mehr zusätzliche Effekte bringen kann. Vor allem auf schweren Böden, bei denen die Wirkung des Hackstriegels an seine Grenzen stoßen kann, ist das Hacken auch in Getreide eine Alternative.