Wegen des hohen Feuchtigkeitsgehalts ist die Gefahr einer bakteriellen Verunreinigung größer als bei anderen Käsearten, deshalb darf in Deutschland üblicherweise nur Frischkäse aus pasteurisierter Milch in den Handel kommen. Einige Biobauern bieten aber besonders kontrollierten Rohmilch-Frischkäse "ab Hof" an. Frischkäse kann durch die Herstellungsverfahren in der Konsistenz stark variieren. Als Frischkäse gelten zum Beispiel auch Hüttenkäse und Mozzarella. Der cremige Rahmfrischkäse wird oft pikant gewürzt angeboten. Meistens werden die Biofrischkäsesorten abgeschmeckt mit Kräutern und Gewürzen angeboten.